Zawartość

• Przegląd oprogramowania
• Obsługiwane typy plików
• Podstawowe rozszerzenie pliku
• Inne rozszerzenia plików używane przez Avogadro 1

Wersja (stan na 12/19/2014)	1
Platformy
Licencja	Otwarte źródło
Kategoria	Naukowy

Więcej informacji (odwiedź stronę wydawcy)

Ocena: 3.6 / 5 (25 głosów)

Przegląd oprogramowania

Główne cechy

• Obsługuje wiele różnych formatów plików cząsteczek, takich jak CML, PDB, XYZ i MDL Mol
• Zapewnia konfigurowalne narzędzia i ustawienia wyświetlania do edycji i wizualizacji cząsteczek
• Pozwala zainstalować dodatkowe funkcje za pomocą wtyczek

Avogadro to open source, międzyplatformowy edytor cząsteczek i wizualizator. Jest on stosowany w modelowaniu molekularnym, chemii obliczeniowej, bioinformatyce, materiałoznawstwie i innych pokrewnych dziedzinach.

Avogadro obsługuje dużą liczbę formatów plików cząsteczek, takich jak CML, HyperChem, MDL Mol, Computational Chemistry Output, PDB i XYZ. Aplikacja zapewnia szereg dostosowywalnych narzędzi używanych do rysowania, nawigowania, manipulowania, wybierania i automatycznej optymalizacji cząsteczek. Do wizualizacji różnych aspektów cząsteczek można wybierać spośród szeregu typów wyświetlania, takich jak wielokąt, rysunek, osie i wiązania wodorowe. Ponadto Avogadro jest rozszerzalny, co pozwala zainstalować dodatkowe funkcje, takie jak polecenia, narzędzia interaktywne i możliwości renderowania.

Avogadro to imponujący edytor cząsteczek i wizualizator przeznaczony zarówno dla studentów, jak i zaawansowanych naukowców. Program obsługuje różne formaty plików cząsteczek, zapewniając jednocześnie przydatne narzędzia i wyświetlacze do edycji i wizualizacji cząsteczek. Avogadro jest doskonałym wyborem dla użytkowników w modelowaniu molekularnym, bioinformatyce, materiałoznawstwie i chemii obliczeniowej.

Obsługiwane typy plików

Podstawowe rozszerzenie pliku

.CML - Plik języka znaczników chemicznych

Inne rozszerzenia plików używane przez Avogadro 1

Obsługiwane typy plików
.CIF	Plik informacji krystalograficznych
.HIN	Plik wejściowy HyperChem
.MOL	MDL Molfile
.NWO	Plik wyjściowy NWChem
.PDB	Plik banku danych białkowych
.SDF	Plik danych struktury
.XYZ	Plik specyfikacji molekuł